中国(包括香港、澳门、台湾)海洋水域有记录的海洋生物种类多达20278个物种，其中水产生物：鱼类3032种，蟹类734种，虾类546种，各种软体动物共2557种(含贝类2456种，头足类101种)。此外还有各种大型经济海藻790种，各种海产哺乳动物29种。如此众多的生物种数说明了中国海洋水产生物资源的丰富和多样。
根据中国大陆记载，中国海洋鱼类是1805种，分隶于738属，213科和37目。按分布区类型，中国近海鱼类以印度－西太平洋分布的种类最多，为916种，占全部种类的50.76％；北太平洋分布的种类次之，为734种，占40.66％；大西洋、印度洋和太平洋共有75种，占4.16％；而仅分布于中国近海的地方种有80种，占4.43％。就适温属性而言，冷温性(4—12℃)有63种(占3.4％)；暖温性(12－25℃)有368种(占20.39％)；暖水性(20－25℃)有1374种(占76.1％)；纯冷水性种类3种(占0.17％)。可见中国海洋鱼类以来自印度－西太平洋的热带和亚热带种类为主，它们广泛分布于南海、东海；而在黄、渤海区，特别是黄海中部和北部，起源于北太平洋温带区的冷温种占了极大优势。渤海是一个封闭程度极大的内海，是许多经济鱼虾类来此产卵和肥育的场所；黄海由于受黑潮高温、高盐水和黄海沿岸冷水团的交互作用，形成了中国仅有的少数几种冷水性鱼类——太平洋鲱(Clupea pallasi)、鳕(Gadus macrocephus)和鲽科(Pleuronectidae)鱼类的产卵、肥育场。东海是一个敞开型的近海生态系统，由于受到黑潮暖流和长江、钱塘江、闽江等径流的交汇影响，形成了世界著名的舟山渔场。南海北部大陆架面积广阔，又有珠江、韩江等径流入海，也是良好的近海渔场。
中国海洋水产生物的特有种类繁多，其中仅鱼类就有100余种。有些有极高的经济价值，例如中国对虾(Penaeus chinensis)等，有些则有重要的科学价值，如文昌鱼(Branchiostoma belcheri)，它对研究动物的进化有着关键价值。
中国海洋虽然生物种类多，产量大(1995年海洋产量达14391297t)，但目前正受到来自多方面的严重威胁。
a．过度捕捞
自60年代以来，捕捞船只数和马力数不断增大，加之现代化渔具的使用，渔法水平的迅速提高，对沿海及近海渔业资源进行掠夺式捕捞，导致资源衰退。传统渔业的主要对象如大黄鱼(Pseudosciaena crocea)、小黄鱼(P．polyactics)、曼氏无针乌贼(Sepiella maindroni)和海蛰(Rhopilema esculenta)等产量正在急剧下降。其中有些种类已形不成渔汛。同时，其分布密度逐年降低，渔获物中优质鱼种减少，劣质鱼种增加。例如大黄鱼，小黄鱼、鳓鱼(Ilisha elongata)、银鲳(Stromateoides argentus)、竹筴鱼(Trachurus japonicus)等主要经济鱼类资源严重衰退，产量下降。有些种类已失去捕捞价值，取而代之的则多属于一些营养级位较低的鱼类，如兰圆鲹(Decapterus maruadsi)、青鳞小沙丁鱼(Sardinella zunasi)、日本鳀(Engraulis japonicus)、黄鲫(Setipinna taty)、红娘鱼(Lepidotrigla microptera)等。鱼种的生物学特性也发生变化。例如小黄鱼、大黄鱼、带鱼、真鲷(Pagrosomus major)、黄姑鱼(Nibea albiflora)、银鲳等产卵群体平均年龄在50年代为4—5龄，个体大而年龄高；到80年代，变成以1—2龄为主，个体更小型化，性成熟变早。过度捕捞不仅影响到鱼类资源，同时也影响到对虾、海参、鲍鱼、扇贝等名贵海产品种的产量。海藻类也遭同样的厄运。如黄渤海区的石花菜(Gelidium amansii)、东海的浒苔(Enteromorpha prolifera)、南海的江蓠(Gracilaria verrucosa)、麒麟菜(Eucheuma sp.)、鹧鸪菜(Caloglossa leprieurii)等的减少就是例子。
b．海水污染
中国海洋渔业资源的衰退出现于60年代中期，那时石油采掘业还处于起步阶段，从陆地排海的工业和生活污水量也不大。从70年代开始，随着石油的大规模开采以及排入海中的工业和生活废水量的大量增加，沿海渔业水域的污染日益严重，水质不断恶化，严重威胁鱼、虾、贝等海产生物的生存。污染也使海水富营养化。近10年来海洋赤潮频颁发生。目前中国已记录到的海洋赤潮生物达127种。赤潮的发生常导致鱼、虾、贝，特别是一些底栖生物大量死亡，严重威胁着生物多样性。例如，渤海原有三个毛蚶(Scapharca subcrenata)的集中产地，由于滥捕和工业污染，如今仅存渤海湾一处，且数量也大幅度下降(从年产4万t下降为目前的1万t)。
c．生境破坏
其中以60年代开始的围海造田对沿海生物多样性的危害最大。以福建为例，福建全省滩涂总面积28万hm2。仅农业围垦就占用了74600hm2，盐场围垦17000hm2，两项合占滩涂面积的1／3。结果损失了贝类的许多附苗埕地和鱼虾类的繁殖场。国家二类保护动物文昌鱼数量大为减少。大规模围垦造田的结果，特别大大缩小并恶化了底栖生物的栖息环境。
d．海水养殖的副作用
中国海洋水产在60年代以前主要依靠捕获野生种群，从60年代开始海水养殖业逐渐兴起，到80年代初，养殖产量已占海洋产量的14％－15％，而到1995年，养殖产量达到28.6％。海水养殖的发展，一方面取得巨大经济效益；但另一方面，也产生一些副作用，其中之一是造成局部污染，降低了当地的生物多样性。
在以过度捕捞为主的影响下，中国海洋水产生物中不少种类已成濒危。如黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)、儒艮(Dugong dugon)、红珊瑚(Corallium japonicum)、鹦鹉螺(Nautilus pompilius)、多鳃孔舌形虫(Glossobalanus polybronchioporus)和黄岛长吻虫(Saccoglossus hwangtauensis)等，目前列入国家一、二类保护的海洋动物达40余种。
